大丈夫です。アトピー性皮膚炎の方でもイオントフォレーシスを受けていただいて問題ありません。多少赤みがあったり、乾燥しているときでもOKです。
ただし湿疹がひどい状態の時には、やめておいたほうが良いでしょう。